Il Consiglio regionale ha eletto gli organismi delle sei commissioni consiliari permanenti, delle commissioni speciali di vigilanza e per la lotta alla mafia e per i comitati per la qualità e la fattibilità delle leggi e di controllo contabile. A presiedere la I Commissione - Affari istituzionali - è stato eletto Giuseppe Caputo (Pdl); vice presidente, Domenico Talarico (IdV) e consigliere segretario, Alfonso Grillo (Lista Scopelliti). La II Commissione - Bilancio e Programmazione - sarà presieduta da Franco Morelli (Pdl); vice presidente, Rosario Mirabelli (Autonomia e diritti) e segretario, Pasquale Tripodi (Udc). La III Commissione - Attività sociali, sanitarie e culturali - sarà presieduta dal consigliere Nazzareno Salerno (Pdl); vice, Ferdinando Aiello (Rifondazione Comunista), segretario, Claudio Parente (Lista Scopelliti). La IV Commissione - Assetto del Territorio e Ambiente - sarà presieduta da Alfonso Dattolo (Udc); vice, Antonio Scalzo (Pd), segretario, Fausto Orsomarso(Pdl). La V Commissione - Riforme e decentramento - sarà presieduta dal consigliere Mario Magno (Pdl); vice, Ottavio Bruni (Autonomia e diritti), segretario, Antonino Rappoccio (Pri). La VI Commissione - Affari dell'Unione europea - sarà presieduta dal consigliere Santi Zappalà (Pdl), vice, Mario Maiolo (Pd) e segretario, Candeloro Imbalzano (Lista Scopelliti). La Commissione per la lotta alla mafia, sarà presieduta da Salvatore Magarò (Lista Scopelliti); vice, Bruno Censore (Pd)e segretario, Salvatore Pacenza(Pdl). La Commissione speciale di vigilanza sarà presieduta da Giulio Serra (Udeur); vice, il consigliere Demetrio Battaglia (Pd) e segretario il consigliere Giovanni Bilardi (lista Scopelliti). Il comitato per la qualità e la fattibilità delle leggi sarà presieduto da Salvatore Pacenza (Pdl); componenti Giovanni Bilardi (Lista Scopelliti); Pasquale Tripodi (Udc), Demetrio Battaglia (Pd), Mario Franchino (Autonomia e diritti). Il Comitato regionale controllo contabile sarà presieduto da Gianluca Gallo (Udc), componenti Candeloro Imbalzano (lista Scopelliti) e Emilio De Masi (Idv).